一、农业生态环境建设。（一）全面启动生态农业县建设。以做好省级生态农业县建设规划为基础，以实施“三清”工程为重点内容，合理开发利用，保护农业自然资源，采取化肥、农药使用的减量化、高效化、无害化等新型农业组装配套技术，有效控制农药、化肥、激素、植物生长调节剂、畜禽粪便、生活污水等农业面源污染及工业“三废”污染，大力发展以沼气为纽带的“一池三改”生态家园富民工程，取得了明显的社会、生态和经济效益。到2005年底，已经有张家港、常熟、吴江、溧阳、扬中、高淳、姜堰、江都、射阳、江阴等首批10个生态农业县（市）通过省级验收。
(二)加强秸秆综合利用，保护改善农村生态环境。通过在夏季秋季召开秸秆综合利用技术现场会，与省环保厅联合成立督查组的形式，采取“禁”与“疏”结合的措施，大力推广秸秆综合利用技术，推广应用麦套稻秸秆全量还田技术、秸秆机械化还田技术，重点推广秸秆养畜、快速腐熟等新型秸秆综合利用技术，到2005年底全省年机械化秸秆直接还田1700万亩次，超高茬麦套稻秸秆全量还田达100万亩次，已建有秸秆气化集中供气站61座。（三）积极开展野生植物保护工作。经国家批准确立了江苏首批野生水生植物及野生大豆原生境保护区，保护濒危的野莼菜、野菱及野生莲、野生大豆等。
二、农村能源建设。一是农村“一池三改”户用沼气工程建设成效显著。重点在苏北、苏中地区组织实施“一池三改”（建沼气池，改厨、改厕、改圈）生态家园富民工程，截止到目前，全省已建有“一池三改”户用沼气工程10万处，其中2005年新建3万处。全省户用沼气池已累计达44.7万户。二是规模化畜禽养殖场沼气工程建设初具规模。大力推广以沼气为纽带的能源环境工程建设技术，走出了一条畜禽养殖场污染治理“减量化、无害化、资源化”综合利用的新路子。截止到2005年底，全省共建成规模畜禽养殖大中型沼气工程143处，总池容3.3万立方米，年处理畜禽粪便149万吨。其中池容在100立方米以上的大中型沼气工程共有55处。三是生活污水净化沼气池建设成效显著。利用厌氧发酵和好氧降解工程技术，将农村小城镇和自然村粪便、生活污水进行净化处理，严格控制生活水污染，实现生活用水的良性循环。2005年新建生活污水净化沼气池2600多处，通过工程建设，有效地解决了项目区农民的生活污水处理问题，控制了生活污水对水体的污染，保护和改善了农村水环境，促进了生活用水的良性循环。
三、农业面源污染防治。一是全面开展重点流域农业面源污染调查。在太湖流域9个县（市）、淮河流域25个县（市）和南水北调工程沿线8个县（市）开展了农业面源污染的调查工作。初步查清了农业面源污染的机理、总量，提出了防治农业面源污染的总体布局和主推控制技术工程。并在吴江、宜兴、武进三个县设立太湖流域污染监控定位监测小区（点）。二是开展农业面源污染综合整治示范区建设。在太湖流域及淮河流域的苏州吴江地区及徐州市沿运河、沿骆马湖开展了农业面源污染控制示范区建设。按照减量化、无害化、高效化的要求，通过集成推广应用高效低毒农药、化肥、秸秆全量还田、秸秆制菌、制气等农业面源污染防治15项技术，积极探索新的生物技术及有效的技术措施及途径，探索机制及体制创新，加强对流域农业面源污染的预警预测研究。
四、农业生态环境监测。从监测方案、检测任务、采样要求、采样点GPS定位及检测执行标准等严格按要求执行。全年总检测无公害农产品基地面积218万亩，为企业提供检测报告数506份，检测环境样品数1564个，检测农产品样品数221个，出具监测有效数据1.3万个。同时，还开展了“利用世界银行贷款加强灌溉农业三期项目”环境质量土壤及农产品的检测工作。
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